1、占用空间小，不受地区、季节限制。
2、培养脱毒作物
3、培养周期短
4、可用组培中的愈伤组织制取特殊的生化制品
5、可短时间大量繁殖，用于拯救濒危植物
6、可诱导之分化成需要的部分，如根和芽
7、解决有些植物产种子少或无的难题，
8、不存在变异，可保持原母本的一切遗传特征
9、投资少，经济效益高
10、繁殖方式多，试用品种多
植物克隆的技术步骤少技术步骤少技术步骤少，所用时间短，极大地节约了综合生产成本和提高了人员的生产效率.从微型材料开始繁殖，可直接培育出在大地自然条件下生长的植株，不需要复杂的练苗步骤，不需任何移栽，对多数植物仅需要15－60天的培育即可用于生产栽培，而且植株均表现开花结果早，丰产性好。如西红柿，4天开始生根，20天开花结果，枸杞当年在苗圃地就开花结果，脱毒薯一叶一芽材料从接种至35天就能分化出小薯，当年栽培可直接在大地收获大脱毒薯。脱毒薯幼苗当年大田栽培产量可达3至4吨，不仅给农民每亩地可节省300斤种薯，而且可是农民每年都能种上原种种薯.切花月季不需移栽从接种一片叶起70天就开花，花大而艳，开花周期比其它方法培育要长。针叶树种如红豆杉、北美红杉、川西云杉、日本落叶松等一般上山定植需4个月的时间。一代一般20-40天开始生根，第二代后生根时间约缩短三分之一的时间。而针叶树种有许多植物组织培养难度很大，基本上不能大规模生产。常规扦插又存在着生根慢、成活率低。致使这些品种的苗木一直在用种子繁殖，后代性状变异非常大
植物克隆技术，可保持原母本的遗传特性，可在短时间内大量繁殖，能解决一些植物繁衍数量少或者无的难题。比如，组培室培养的“东南景天”，能够吸收土壤中的重金属，修复土壤，可通过扦插的方式繁殖，但繁殖速度慢，不能满足田间种植需求，通过“克隆”，可以实现几何倍数增长。
又如组培室中的雪花福禄桐苗，一瓶里有10团芽，密密麻麻的。而这些一开始是由十株苗克隆而来。随机拿起一个装有雪花福禄桐苗的瓶子，通过半透明的培养基，可以清晰地看到，苗上还长出了很多新芽。